Guide 2026

Logiciel de comptabilité pour indépendants
en Suisse

Comparez les logiciels de comptabilité suisses pour freelances et indépendants. Découvrez ce que vous devez suivre (factures QR, dépenses, TVA), quelles fonctionnalités comptent, et explorez des options axées sur les tarifs—avec FAQ et guide de choix.

Illustration d'un tableau de bord d'analyse comptable

Si vous êtes indépendant en Suisse, un logiciel de comptabilité ne sert pas qu'à « tenir les comptes »—il vous aide à être payé plus vite, rester conforme à la TVA, et rendre la période fiscale indolore (pour vous et votre fiduciaire). Ce guide vous donne une checklist pratique de ce que vous devez suivre, quelles fonctionnalités rechercher dans les outils comptables suisses (y compris la facture QR), et une comparaison des options populaires—avec une recommandation claire selon votre façon de travailler.

Dernière mise à jour : 31 janvier 2026 (les tarifs et fonctionnalités peuvent changer—à vérifier trimestriellement).

Note : Ces informations sont générales et ne constituent pas des conseils fiscaux ou juridiques. Les exigences varient selon le canton et votre situation.


Ce que signifie « indépendant » en Suisse (et pourquoi c'est important pour la comptabilité)

En Suisse, « indépendant » signifie généralement que vous opérez comme raison individuelle (Einzelunternehmen / entreprise individuelle) ou structure similaire où vous gérez personnellement l'activité et êtes responsable de son administration.

Cela impacte la comptabilité de trois façons majeures :

  1. Vous êtes responsable de la tenue précise des revenus et dépenses (même si vous engagez une fiduciaire plus tard).
  2. Vous devrez peut-être gérer la TVA selon votre chiffre d'affaires et votre activité.
  3. Vous avez besoin d'une documentation propre (factures, reçus, preuves bancaires) pour justifier votre déclaration fiscale et vos résultats.

Beaucoup de freelances commencent avec Excel—jusqu'aux premiers « chocs de réalité suisse » : factures QR, transactions bancaires mixtes privé/professionnel, clients qui paient en retard, questions TVA, et reporting de fin d'année. Un bon logiciel réduit toutes ces frictions.

Checklist de conformité

Checklist de conformité pour indépendants en Suisse : ce que vous devez suivre

Voyez votre système comptable comme des routines hebdomadaires répétables. L'objectif n'est pas la perfection—c'est la traçabilité (vous pouvez expliquer chaque chiffre) et la documentation vérifiable (vous pouvez le prouver).

  • 🧾
    Factures (dont factures QR suisses)

    Des factures professionnelles faciles à payer—et à rapprocher.

  • 📸
    Dépenses + conservation des justificatifs

    { "Comptabilité basée sur la preuve": "chaque dépense doit avoir un reçu et une catégorie." }

  • 🧮
    TVA

    Factures conformes TVA, taux corrects, et reporting propre par période.

  • 🏦
    Trésorerie + provisions

    Visibilité continue pour que les impôts et l'AVS ne deviennent pas des surprises.

Factures
  • Facture #3

    Magic Heidi

    CHF 500

    Jan 29

  • Facture #2

    Webbiger LTD

    CHF 2000

    Jan 24

  • Facture #1

    John Doe

    CHF 600

    Jan 20

Factures QR suisses

Des factures qui vous font payer plus vite avec la facturation QR

Au minimum, vous avez besoin de factures claires, professionnelles et faciles à payer. En Suisse, les clients s'attendent de plus en plus aux factures QR « de base ». Des factures plus propres = paiement plus rapide, moins d'échanges d'emails, et rapprochement bancaire facilité.

Liste de factures avec workflow de facturation suisse
Dépenses + justificatifs

Des dépenses que vous pouvez réellement prouver

La comptabilité suisse ne porte pas que sur les totaux. Elle porte aussi sur la preuve. Suivez le montant, la date, le fournisseur, la catégorie, le traitement TVA (si assujetti), et conservez le justificatif (photo/PDF) joint à la transaction—pour ne pas fouiller dans vos emails et photos en fin d'année.

Capture de dépenses mobile et scan de justificatifs

TVA : seuil, workflow et « TVA volontaire »

La TVA est l'une des principales raisons pour lesquelles les indépendants en Suisse passent d'Excel à un vrai logiciel. Même si votre activité est simple, la TVA ajoute de la structure :

  • Vous devrez peut-être vous assujettir à la TVA une fois que vous dépassez le seuil de chiffre d'affaires (et dans certains cas, vous pouvez vous assujettir volontairement).
  • Vous devez émettre des factures avec le traitement TVA correct et conserver les justificatifs TVA.
  • Vous aurez besoin de décomptes TVA périodiques et de totaux propres par taux.

Ce que le logiciel doit faire ici : taux TVA suisses et logique de reporting intégrés, possibilité de marquer correctement les transactions, et exports partageables avec une fiduciaire.

Conseil : Si vous ne savez pas si vous devez vous assujettir ou comment traiter la TVA dans des cas limites, consultez une fiduciaire. Le bon logiciel facilite la fourniture de données propres—mais ne remplace pas les conseils professionnels.

Trésorerie + planification AVS (éviter les surprises)

Même sans salariés, les indépendants devraient traiter la trésorerie comme une tâche quasi-réglementaire : vous voulez mettre de l'argent de côté régulièrement pour les impôts et l'assurance sociale (AVS), basé sur vos résultats réels.

Une approche simple utilisée par beaucoup de freelances :

  • Suivre les revenus et dépenses chaque semaine
  • Maintenir un « compte tampon impôts + AVS » ou compte bancaire séparé
  • Réviser mensuellement : chiffre d'affaires, marge, paiements à venir

Ce que le logiciel doit faire ici : visibilité en temps réel du bénéfice, flux bancaires/imports, et catégories qui rendent vos chiffres de fin d'année crédibles.

Checklist fonctionnalités

Ce qu'il faut rechercher dans un logiciel
de comptabilité suisse (liste rapide)

Tous les « logiciels de comptabilité » ne sont pas adaptés à la Suisse. Utilisez cette checklist pour présélectionner rapidement.

Support facture QR suisse

Non négociable pour beaucoup de clients suisses. Vérifiez la génération de factures QR, les coordonnées de paiement correctes, et les PDF propres.

  • Génération de factures QR alignée sur les attentes suisses
  • Gestion correcte QR-IBAN vs IBAN (selon les cas)
  • PDF propre + modèles multilingues (DE/FR/IT/EN)

TVA adaptée à votre réalité

Si vous êtes assujetti TVA (ou pourriez le devenir), vous voulez des fonctionnalités TVA qui préviennent les erreurs et simplifient le reporting.

  • Taux TVA suisses et calcul correct
  • Facturation conforme TVA
  • Décomptes TVA et exports par période
  • Factures exonérées de TVA si applicable

Import bancaire + rapprochement

Pour la plupart des indépendants, le plus grand gain d'automatisation est de réduire la saisie manuelle et rapprocher correctement les paiements.

  • Import relevé bancaire (CSV/CAMT si disponible)
  • Rapprocher les paiements de factures aux transactions bancaires
  • Règles simples pour transactions récurrentes
  • Statut clair « payé/impayé » sans Excel

Capture de justificatifs + workflow documentation

Vos déductions ne valent que vos preuves. Joignez les justificatifs là où vous enregistrez la dépense.

  • Scan mobile de justificatifs
  • Pièces jointes par transaction
  • OCR (optionnel, mais grand gain de productivité)
  • Piste d'audit si vous collaborez avec d'autres

Exports + collaboration fiduciaire

Même si vous faites le travail vous-même, la fin d'année inclut souvent une fiduciaire. Facilitez la transmission.

  • Exports factures, dépenses, journal/grand livre selon besoins
  • Partage facile de documents (pièces jointes incluses)
  • Accès comptable optionnel sans complexité supplémentaire
  • Structure de données propre pour clôture annuelle

Tarification adaptée aux indépendants

Le prix n'est pas que l'abonnement mensuel le moins cher—surveillez où les fonctionnalités clés sont verrouillées.

  • Version gratuite réellement utilisable
  • Rapprochement bancaire / OCR / exports non bloqués trop tôt
  • Réductions annuelles vs mensuelles
  • Évolutions prévisibles quand votre charge augmente
Comparaison

Logiciels de comptabilité pour indépendants en Suisse : tarifs + meilleur usage

Les prix sont des exemples publics et peuvent changer. Confirmez sur la page tarifs de chaque fournisseur avant de décider.

LogicielIdéal pourPoints forts suissesTarifs types (exemples publics)Points d'attention
Magic HeidiIndépendants qui veulent une boîte à outils tout-en-un (facturation + dépenses + comptabilité) sans complexitéFactures QR, taux TVA suisses, conçu pour les workflows des indépendants suissesSi vous avez besoin d'une suite « ERP » PME complète, vous voudrez peut-être une plateforme plus large
bexioEntreprises en croissance qui veulent une administration plus large (comptabilité + autres opérations)Écosystème solide, positionné pour les PMEPeut sembler lourd pour les freelances solo
KLARAApproche modulaire « choisissez ce dont vous avez besoin »Centré sur la Suisse, tarification modulaireLes modules/options peuvent rendre les coûts moins prévisibles
smallinvoiceFacturation d'abord avec une évolution claireFocus facturation fort ; messagerie collaborative pour fiduciairePour une automatisation comptable plus poussée, vérifiez bien le périmètre du plan
Banana ComptabilitéPersonnes qui veulent un logiciel de bureau et du contrôleStyle offline/bureau ; structure comptable familièreMoins « mobile-first » ; workflows peuvent être plus manuels
Écosystème Swiss21 / AbaNinjaUtilisateurs sensibles au prix qui veulent un écosystème suisse avec un départ gratuitCentré sur la Suisse, point d'entrée populaireChangements d'abonnement depuis le 01.01.2025 ; Pro référencé à CHF 49 à partir de cette dateLimitations version gratuite peuvent forcer des upgrades (automatisation/rapprochement bancaire/OCR/support)

Comment utiliser ce tableau :

  • Si vous facturez surtout et suivez des dépenses, priorisez facturation QR + capture justificatifs + exports simples.
  • Si vous êtes assujetti TVA, priorisez gestion TVA + rapprochement + décomptes TVA propres.
  • Si vous vous développez, priorisez workflows multi-utilisateurs + reporting approfondi + intégrations.

Guide de choix rapide : quel outil correspond à votre situation ?

Choisissez le profil qui vous ressemble le plus—puis testez 2-3 outils avec de vraies factures et vraies dépenses.

🌱

Nouvel indépendant (configuration suisse la plus simple)

Factures QR, justificatifs mobiles, vue simple du bénéfice sans jargon.
🧮

Focus TVA (moins d'erreurs)

Logique TVA suisse, décomptes, et rapprochement propre.
💸

Sensible au prix (facturation d'abord)

Plan gratuit/bas coût utilisable avec facturation QR et bases.

« Je suis nouvel indépendant et je veux la configuration suisse la plus simple »

Vous voulez un outil qui facilite :

  • La création immédiate de factures QR
  • La capture de justificatifs depuis votre téléphone
  • Une vision simple du bénéfice sans jargon comptable

Présélection : Magic Heidi, smallinvoice (si vous êtes facturation-d'abord)

« J'ai besoin du support TVA et je veux moins d'erreurs »

Vous voulez :

  • La logique TVA suisse intégrée
  • Des décomptes TVA clairs
  • Import/rapprochement bancaire pour que paiements et factures correspondent proprement

Présélection : Magic Heidi, KLARA, bexio (selon la complexité)

« J'ai surtout besoin de facturation et je suis sensible au prix »

Vous voulez :

  • Une version gratuite utilisable ou un plan bas coût
  • Des modèles de factures professionnels et facturation QR
  • Un suivi de dépenses basique

Présélection : smallinvoice, écosystème Swiss21/AbaNinja (vérifier les limitations), Magic Heidi (si vous voulez la comptabilité incluse)

« Je préfère un logiciel de bureau et je suis à l'aise de faire les choses manuellement »

Vous voulez :

  • Contrôle offline
  • Un workflow comptable classique
  • Tarif annuel prévisible

Présélection : Banana Comptabilité

« Je me développe au-delà du solo : plus de processus, peut-être des employés plus tard »

Vous voulez :

  • Fonctionnalités d'administration d'entreprise plus larges
  • Accès multi-utilisateurs et workflows structurés
  • Options de reporting et d'intégration

Présélection : bexio, KLARA (croissance modulaire)

Recommandation

Pourquoi beaucoup de freelances suisses choisissent Magic Heidi

Magic Heidi est positionné comme une boîte à outils tout-en-un pour les indépendants suisses—conçu pour la réalité quotidienne de la facturation, des dépenses et de la comptabilité de base sans vous donner l'impression de gérer un service financier d'entreprise.

Facturation mobile avec workflow facture QR

Magic Heidi est souvent un excellent choix si vous :

  • Voulez des factures QR et des flux de facturation adaptés à la Suisse
  • Préférez un système simple pour dépenses + justificatifs
  • Voulez des fonctionnalités compatibles TVA sans courbe d'apprentissage abrupte
  • Voulez une façon propre de collaborer avec une fiduciaire plus tard (exports, registres clairs)
  • Ne voulez pas assembler des outils séparés pour la facturation et la comptabilité

Plans (selon affichage public) :

  • Gratuit (limité à 3 factures / 3 dépenses)
  • CHF 30/mois
  • CHF 299/an

FAQ

FAQ : logiciel de comptabilité pour indépendants en Suisse

Ai-je besoin d'une comptabilité en partie double comme raison individuelle en Suisse ?

Cela dépend de votre taille et situation. Beaucoup d'indépendants peuvent commencer avec un suivi simple revenus/dépenses, mais les exigences peuvent augmenter selon le chiffre d'affaires ou la forme juridique. En cas de doute, demandez à une fiduciaire—puis choisissez un logiciel qui peut évoluer avec vous (ou exporter proprement si vous upgradez plus tard).

Quand dois-je m'assujettir à la TVA en Suisse ?

L'assujettissement TVA dépend du chiffre d'affaires et d'autres facteurs, et certaines entreprises s'assujettissent volontairement. Confirmez votre situation de seuil spécifique avec les directives officielles ou une fiduciaire, puis utilisez un logiciel qui supporte les taux TVA suisses et le reporting pour ne pas reconstruire votre processus plus tard.

Un logiciel de comptabilité peut-il générer correctement des factures QR suisses ?

Beaucoup d'outils revendiquent le support QR, mais vous devriez vérifier qu'il couvre ce dont vous avez besoin (sortie PDF de facture QR correcte et coordonnées de paiement justes). Si les clients en Suisse attendent des factures QR, traitez cette fonctionnalité comme indispensable.

Puis-je facturer en plusieurs langues (DE/FR/IT/EN) ?

Si vous travaillez dans plusieurs cantons—ou avec des clients internationaux—recherchez des modèles de factures multilingues et des champs de formulation flexibles. Même si votre interface est en français, vos factures peuvent devoir être en allemand ou français pour le confort client.

Le logiciel supporte-t-il l'import de relevés bancaires et le rapprochement des paiements ?

L'import bancaire et le rapprochement sont parmi les plus gros gains de temps pour les freelances. Recherchez le support d'imports de relevés bancaires (et toutes options de flux bancaire disponibles), et le rapprochement de paiements qui connecte les paiements de factures aux transactions bancaires.

Comment partager mes données avec une fiduciaire ?

Choisissez un logiciel qui offre des exports de factures et dépenses, un export journal/grand livre (si nécessaire), et les pièces jointes incluses (justificatifs liés aux transactions). Certains outils offrent aussi des fonctionnalités de collaboration directe ou un accès comptable.

Le scan de justificatifs (OCR) est-il nécessaire ?

Pas strictement, mais c'est souvent rentable. L'OCR accélère la saisie et réduit les erreurs—surtout avec beaucoup de petites dépenses (déplacements, repas, fournitures). Si vous êtes sensible au budget, priorisez capture + pièce jointe d'abord ; ajoutez l'OCR quand le gain de temps justifie l'upgrade.

Quels registres dois-je conserver comme indépendant ?

Conservez les factures émises, les factures fournisseurs et justificatifs, les relevés bancaires et confirmations de paiement, et la documentation TVA (si assujetti). Le logiciel aide quand il stocke les justificatifs à côté des transactions et facilite les exports.

Puis-je changer d'outil plus tard sans tout perdre ?

Oui, mais changer est plus facile quand votre outil supporte l'export de factures (PDF + données), listes clients/contacts, et dépenses plus pièces jointes. Avant de vous engager, vérifiez les options d'export et si les pièces jointes sont téléchargeables en masse.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité en Suisse pour freelances ?

Le meilleur choix dépend de votre workflow (facturation-d'abord vs comptabilité complète), complexité TVA, besoin d'automatisation (rapprochement bancaire, OCR), et si vous collaborez avec une fiduciaire. Utilisez le Guide de choix rapide pour présélectionner 2-3 options, puis testez-les avec de vraies factures et dépenses.

Plan de configuration simple (pour vraiment vous y tenir)

Si vous voulez que votre comptabilité reste « sous contrôle » toute l'année, établissez une routine que vous pouvez maintenir :

  1. Créez les factures dans l'outil (utilisez le format facture QR si vous facturez des clients suisses).
  2. Capturez les justificatifs immédiatement (scan/photo mobile → joindre à la dépense).
  3. Importez les transactions bancaires chaque semaine et rapprochez les paiements.
  4. Révision mensuelle (30 minutes) : vérifiez les factures impayées, principales catégories de dépenses, et mettez de l'argent de côté pour impôts/AVS.
  5. Trimestriellement : exportez un pack de rapports pour votre fiduciaire (ou pour vos propres registres).

Tarification simple. Sans surprises.

Un plan. Toutes les fonctionnalités. Résiliable à tout moment.

Essai Gratuit

CHF0/month
À vie
  • 3 factures
  • 3 dépenses
  • Toutes les fonctionnalités débloquées
  • Pas de carte bancaire requise
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CHF30/month
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  • Factures illimitées
  • Dépenses illimitées
  • Scan IA des dépenses
  • Toutes les plateformes incluses
  • Import relevé bancaire
  • Gestion TVA suisse
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