Voici chaque outil que j'ai testé, avec des avis honnêtes sur le public visé :
Prix : Gratuit (3 factures/mois) | CHF 30/mois ou CHF 299/an
Magic Heidi se positionne comme l'alternative orientée indépendants face aux plateformes PME plus lourdes. Conçu par un indépendant suisse pour les indépendants suisses, il allie facilité d'utilisation et fonctionnalités complètes.
Fonctionnalités phares :
- Scan de reçus par IA : photographiez vos reçus, les données sont extraites automatiquement (montant, date, TVA, catégorie, fournisseur)
- Interface moderne et soignée sur web, iPhone, Android, Mac et Windows
- Génération automatique de QR-factures avec adresses structurées
- Import de relevés bancaires avec rapprochement intelligent
- Gestion complète de la TVA suisse avec les taux 2026 à jour
- Disponible en anglais, allemand, français, italien
Le compromis : Plus récent sur le marché que les acteurs établis, donc moins d'intégrations tierces. Cible délibérément les indépendants et les micro-entreprises — pas adapté aux équipes de plus de 5 personnes ni aux besoins ERP complexes.
Parfait pour : Les indépendants facturant entre CHF 50K et 500K par an qui veulent un logiciel moderne qui fonctionne simplement, sans nécessiter de connaissances comptables.
2. bexio — Le leader du marché suisse
Prix : Starter CHF 45/mois (CHF 35/mois en annuel) | Pro CHF 75/mois | Pro+ CHF 125/mois
Tarifs vérifiés en janvier 2026 via bexio.com
Avec plus de 80'000 utilisateurs PME suisses, bexio domine le marché. C'est la plateforme la plus complète, qui gère tout, de la facturation à la gestion de projet en passant par les salaires.
Fonctionnalités phares :
- Intégration poussée avec les banques suisses et les plateformes e-banking
- Fonctionnalités CRM pour la gestion de la relation client
- Suivi du temps et facturation par projet
- Gestion des stocks (si vous vendez des produits)
- Gestion des salaires quand vous êtes prêt à embaucher
- Plus de 100 intégrations tierces
- Certifié ISO 27001 et ISAE 3402
Le compromis : Plus complexe que nécessaire si vous êtes un indépendant aux besoins simples. Le prix grimpe vite — les modules et utilisateurs supplémentaires peuvent facilement dépasser CHF 200/mois. Certains utilisateurs signalent un ralentissement de l'innovation ces dernières années.
Parfait pour : Les indépendants approchant les CHF 200K+ de chiffre d'affaires qui prévoient de passer à une véritable société, ou ceux qui ont besoin de CRM et de gestion de projet en plus de la comptabilité.
Prix : Gratuit (basique) | CHF 340/an (PRO)
Tarifs vérifiés en janvier 2026 via swissmadesoftware.org
CashCtrl prouve que « gratuit » ne veut pas dire « limité ». Cette plateforme bâloise propose une version gratuite permanente avec de vraies fonctionnalités, pas un essai qui expire.
Fonctionnalités phares :
- Version gratuite avec comptabilité en partie double complète (introuvable ailleurs)
- Basé sur le cloud, accessible partout avec une connexion internet
- Gestion complète de la TVA suisse
- Support multi-devises
- Modèles de factures personnalisables
- Accès API pour les développeurs
Le compromis : Pas d'applications mobiles dédiées (navigateur uniquement). L'interface est fonctionnelle mais moins soignée que Magic Heidi ou bexio. Convient mieux aux utilisateurs à l'aise avec les applications web. Première augmentation de prix en 10 ans (anciennement CHF 295/an).
Parfait pour : Les nouveaux indépendants sous CHF 100K de chiffre d'affaires, ou les utilisateurs expérimentés qui préfèrent un logiciel gratuit et n'ont pas de problème avec les outils en ligne.
Prix : Dès CHF 39/mois | Essai gratuit de 14 jours
Développé par ePost (La Poste suisse), KLARA adopte une approche différente : automatiser tout ce qui est possible. La plateforme affirme automatiser jusqu'à 42% des tâches administratives courantes.
Fonctionnalités phares :
- Automatisation exceptionnelle des documents et du routage
- Scan et catégorisation des reçus par IA
- Écritures comptables automatiques à partir des factures
- Rapprochement bancaire automatique sans intervention manuelle
- Forte intégration avec les services de La Poste suisse
- Adapté aux startups et associations
- Module de gestion des stocks inclus
Le compromis : Pas de vrai plan gratuit (seulement 14 jours d'essai). Moins d'intégrations tierces que bexio. Peut être excessif si vous avez juste besoin de facturer simplement.
Parfait pour : Les indépendants et petites entreprises qui valorisent l'automatisation et le design moderne, en particulier les startups et associations.
Prix : Gratuit (Starter) | CHF 21/mois (Basic) | CHF 49/mois (Pro, depuis janvier 2025)
Changement de tarif vérifié en janvier 2026 via le centre d'aide swiss21.org
SWISS21 surprend avec un plan gratuit véritablement fonctionnel — pas un essai amoindri. Plus de 60'000 utilisateurs ont adopté la plateforme.
Fonctionnalités phares :
- Facturation QR illimitée sur le plan gratuit
- Comptabilité de base et gestion de projet incluses
- Module helpdesk disponible
- Plus de 70 intégrations d'applications
- Hébergement suisse des données, conforme RGPD
Le compromis : Les utilisateurs gratuits voient des offres tierces. Le rapprochement bancaire et les fonctionnalités d'automatisation sont limités sur les plans inférieurs. Le plan « gratuit » a changé de périmètre depuis 2025 — vérifiez ce qui est inclus dans votre plan.
Parfait pour : Les indépendants au budget serré avec moins de CHF 50'000 de chiffre d'affaires qui ont besoin d'un logiciel gratuit mais fonctionnel et qui acceptent les limites de chaque niveau.
Prix : Dès CHF 20/mois (location) ou CHF 600+ (achat)
Avec plus de 30 ans sur le marché suisse, Crésus accompagne les entreprises et les fiduciaires depuis les débuts de la comptabilité informatisée. Stable, fiable et profondément intégré au réseau fiduciaire suisse.
Fonctionnalités phares :
- Multiplateforme : PC, Mac, Linux
- Des centaines de fiduciaires utilisent et recommandent Crésus
- Interface exceptionnellement intuitive (courbe d'apprentissage la plus faible de la catégorie)
- Excellente conformité suisse : TVA, QR-factures, numéro CHE
- Facturation multilingue native (DE/FR/IT/EN)
- Modules personnalisables (multi-devises, consolidation)
Le compromis : L'interface montre son âge comparée aux outils cloud modernes. Souvent livré avec le module comptable, que vous en ayez besoin ou non. Mentalité « desktop d'abord ».
Parfait pour : Les indépendants non techniques qui privilégient la facilité d'apprentissage, ou ceux qui travaillent étroitement avec un fiduciaire utilisant déjà Crésus.
Prix : CHF 25/mois (standard) | CHF 40/mois (team) | Réduction annuelle disponible
Infinity se positionne comme l'option la plus moderne et tournée vers l'IA du marché suisse. Plus de 50 nouvelles fonctionnalités livrées rien qu'en 2024.
Fonctionnalités phares :
- Live Accounting avec suggestions de comptabilisation par IA
- Reconnaissance de documents sophistiquée
- Interface moderne conçue pour 2026
- Interface multilingue (DE/FR/EN)
Le compromis : Orienté marché germanophone. Web uniquement (pas d'applications mobiles natives). Nouvel entrant, donc base d'utilisateurs et communauté plus restreintes.
Parfait pour : Les indépendants à l'aise avec la technologie qui veulent une automatisation IA de pointe et qui acceptent une expérience web uniquement.
8. Smallinvoice — Des plans de facturation structurés
Prix : Plan gratuit | CHF 15/mois (Starter) | CHF 30/mois (Professional, 3 utilisateurs) | CHF 45/mois (5 utilisateurs)
Tarifs vérifiés en janvier 2026 via smallinvoice.ch
Un outil de facturation suisse avec une structure de plans claire, destiné aux indépendants, startups et PME.
Fonctionnalités phares :
- Factures QR avec modèles
- Bases CRM et suivi de projets
- Plans basés sur le nombre d'utilisateurs, adaptés aux petites équipes
- Exports pour la collaboration comptable
- Disponible en anglais, français, allemand
Le compromis : L'interface semble complexe. La mise en place des factures QR nécessite des étapes supplémentaires. Les fonctionnalités IA sont limitées par rapport à Magic Heidi ou KLARA.
Parfait pour : Les indépendants qui ont besoin de gestion de projet intégrée à la facturation et qui veulent des plans tarifaires transparents.
Prix : Gratuit (jusqu'à 70 transactions) | CHF 69/an (Professional) | CHF 149/an (Advanced)
Depuis 1990, Banana accompagne les entreprises suisses avec une comptabilité fiable et abordable. Si vous êtes à l'aise avec les tableurs, l'interface de Banana vous semblera immédiatement familière.
Fonctionnalités phares :
- Application de bureau (Windows, Mac, Linux) — les données restent sur votre ordinateur
- Interface de type tableur (les utilisateurs d'Excel s'adaptent instantanément)
- Comptabilité en partie double complète
- Outils de planification budgétaire et prévisionnelle
- Disponible en allemand, français, italien, anglais
Le compromis : Pas d'applications mobiles ni de synchronisation cloud. Saisie manuelle des données (pas de flux bancaires automatiques). Nécessite des connaissances comptables. L'interface semble datée.
Parfait pour : Les indépendants soucieux de leur budget qui préfèrent un logiciel de bureau, tiennent leur propre comptabilité et acceptent la saisie manuelle des transactions.
Prix : Plan gratuit | Environ CHF 21/mois (Advanced)
AbaNinja met des décennies d'expertise comptable suisse (Abacus, fondé dans les années 1980) dans un format cloud simplifié.
Fonctionnalités phares :
- Soutenu par Abacus, un nom de confiance dans la comptabilité suisse
- Interface claire et moderne conçue pour les non-comptables
- Bon support TVA suisse et QR-factures
- Bonnes options d'intégration bancaire
Le compromis : Moins riche en fonctionnalités que bexio, moins moderne que Magic Heidi. Dans la moyenne dans la plupart des catégories — ce qui peut être exactement ce que certains indépendants recherchent.
Parfait pour : Les indépendants qui veulent un logiciel fiable et sans surprises d'une entreprise suisse établie, sans payer le prix de bexio.
Prix : Plan gratuit disponible | CHF 15–30/mois pour les plans payants
Un acteur suisse plus petit, axé sur le marché germanophone avec une approche « simplicité d'abord ».
Fonctionnalités phares :
- Prise en main simple et design épuré
- Facturation et workflows pour petites entreprises
- Option peu coûteuse pour les besoins de base
Le compromis : Interface en allemand uniquement. Profondeur limitée pour les QR-factures et les rapports TVA par rapport aux concurrents plus importants. Écosystème plus restreint.
Parfait pour : Les indépendants germanophones qui privilégient la simplicité et le coût réduit avant tout.
Prix : CHF 9/mois ou CHF 96/an
Inspiré du traditionnel « livre de lait » suisse, Milchbüechli ne propose que le suivi des revenus et des dépenses. Rien de plus.
Important : Ce n'est pas un outil de facturation. Il ne génère ni factures ni QR-factures. C'est uniquement de la tenue de comptes.
Parfait pour : Les indépendants qui utilisent un outil de facturation séparé et qui ont juste besoin d'un suivi de dépenses ultra-simple en allemand.
Winbiz — Fonctionnalités PME abordables incluant les QR-factures suisses, la TVA et les salaires. Plus orienté PME mais accessible pour les activités freelance plus importantes.
Atlanto (CHF 43/mois) — Outils robustes mais conçus pour les entreprises, pas les indépendants solo. Tarification multi-utilisateurs dont vous n'avez probablement pas besoin.
Zoho Books + module QR-facture suisse — Si vous utilisez déjà l'écosystème Zoho à l'international, une extension QR-facture suisse peut le rendre utilisable en Suisse. Attention aux spécificités des déclarations TVA et à la profondeur de la localisation.
Générateurs légers de QR-factures (mobile) — Certains indépendants ont juste besoin du workflow le plus simple possible : générer une facture QR suisse rapidement. Ces applications mobiles existent mais offrent une gestion TVA limitée et pas de collaboration avec un comptable.
