Automatisez vos factures en Suisse : 8 outils comparés pour 2025
Vous perdez encore des heures à créer vos factures manuellement ? En moyenne, les indépendants suisses passent 12 heures par mois sur des tâches administratives qui pourraient être automatisées.
Le coût caché de la facturation manuelle
Depuis novembre 2025, les nouvelles exigences QR-facture rendent certains logiciels obsolètes. Vos factures avec adresses non structurées risquent d'être rejetées par les banques.
Les exigences QR-facture
novembre 2025
Votre logiciel actuel est-il conforme ? C'est la première question à vous poser.
Adresses structurées obligatoires
Les coordonnées doivent être divisées en éléments distincts (rue, numéro, NPA, ville)
Nouveaux caractères spéciaux
Support des trémas et caractères additionnels requis
Délai de transition
D'ici novembre 2026, les banques supprimeront les ordres permanents utilisant l'ancien format
Les 8 meilleurs logiciels de facturation suisses
Comparatif rapide des solutions disponibles sur le marché suisse en 2025
| Logiciel | Prix/mois | QR-facture 2025 | Idéal pour |
|---|---|---|---|
| Magic Heidi | Dès CHF 9 | ✓ | Indépendants |
| Bexio | Dès CHF 45 | ✓ | PME |
| KLARA | Gratuit | ✓ | Micro-entreprises |
| Smallinvoice | Dès CHF 9 | ✓ | Startups |
| CashCtrl | Gratuit | ✓ | Débutants |
| Swiss21 | Gratuit | ✓ | Associations |
| Accounto | Sur devis | ✓ | Fiduciaires |
| Crésus | Dès CHF 290/an | ✓ | PME romandes |
Magic Heidi : conçu par des Suisses, pour des Suisses
Magic Heidi se distingue par sa simplicité radicale. Pas de menus complexes, pas de fonctionnalités superflues — juste l'essentiel pour facturer rapidement. Vous créez votre première facture en moins de 5 minutes.
Pourquoi choisir
Magic Heidi ?
Pour les indépendants qui veulent une solution simple sans courbe d'apprentissage.
QR-factures conformes
Conformité totale aux normes 2025 avec adresses structurées.
- QR-factures aux normes novembre 2025
- Taux de TVA suisses préconfigurés
- Conversion automatique en CHF
- Numéro IDE/CHE intégré
Multilingue & Multi-plateforme
Interface disponible en français, allemand et anglais.
- Applications iPhone et Android
- Applications Mac et Windows
- Synchronisation automatique
- Facturation depuis n'importe où
Simplicité radicale
Créez votre première facture en 5 minutes.
- Aucune formation requise
- Interface intuitive
- Essai gratuit disponible
- Support réactif
Bexio : le leader du marché suisse
Avec plus de 80'000 clients, Bexio domine le segment des PME suisses. Racheté par la Mobilière en 2018, le logiciel offre une suite complète qui va bien au-delà de la facturation.
Points forts :
- Intégrations bancaires directes (UBS, PostFinance, Raiffeisen, ZKB)
- Accès fiduciaire intégré
- Gestion des salaires Swissdec
- Automatisation pouvant faire économiser jusqu'à 12 heures/mois
Limites :
- Prix élevé pour les indépendants (CHF 45/mois minimum)
- Complexité parfois excessive pour des besoins simples
Pour qui ? Les PME en croissance qui ont besoin d'un ERP complet, pas seulement d'un outil de facturation.
Prix :
- Starter : CHF 45/mois (1 utilisateur)
- Pro : CHF 75/mois (jusqu'à 3 utilisateurs)
- Pro+ : CHF 125/mois (jusqu'à 25 utilisateurs)
KLARA : l'option gratuite de la Poste Suisse
KLARA appartient majoritairement à la Poste Suisse et compte plus de 30'000 utilisateurs. Son argument principal ? La gratuité pour les fonctions de base.
Points forts :
- Facturation gratuite
- Adossé à une institution suisse de confiance
- Simple pour les micro-entreprises
Limites :
- Fonctionnalités limitées dans la version gratuite
- Moins adapté aux besoins complexes
- Support parfois lent
Pour qui ? Les très petites entreprises avec des besoins basiques et un budget serré.
Smallinvoice : sécurité et simplicité
Développé spécifiquement pour les PME et startups suisses, Smallinvoice mise sur la sécurité des données.
Points forts :
- Données hébergées exclusivement en Suisse
- Cryptage 256-bit
- Conformité RGPD pour les clients européens
- QR-factures en un clic
Pour qui ? Les entrepreneurs qui manipulent des données sensibles et veulent une garantie de confidentialité.
Prix : Dès CHF 9/mois.
CashCtrl : idéal pour débuter
CashCtrl cible les utilisateurs sans expérience comptable. L'interface est conçue pour être comprise immédiatement, sans formation.
Points forts :
- Version gratuite fonctionnelle
- Prise en main intuitive
- Adapté aux débutants complets
Limites :
- Fonctionnalités avancées limitées
- Moins d'intégrations que les concurrents
Pour qui ? Les nouveaux indépendants qui découvrent la gestion administrative.
Swiss21 : l'écosystème tout-en-un
Swiss21 propose un système ERP gratuit pour les PME, clubs et associations suisses. L'approche est modulaire : vous activez uniquement ce dont vous avez besoin.
Points forts :
- Gratuit pour démarrer
- Suite complète (CRM, comptabilité, facturation)
- Adapté aux associations
Pour qui ? Les structures qui veulent digitaliser progressivement sans investissement initial.
Accounto : l'IA au service des fiduciaires
Fondé à Zurich en 2016 et racheté par AXA, Accounto utilise l'intelligence artificielle pour automatiser la comptabilité.
Points forts :
- Reconnaissance automatique des documents (OCR)
- Règles d'allocation intelligentes
- Réconciliation bancaire automatisée
Limites :
- S'est retiré du marché B2C direct
- Cible principalement les fiduciaires
Pour qui ? Les sociétés fiduciaires qui gèrent plusieurs clients PME.
Note sur Sage en Suisse
Attention : Sage a vendu ses activités suisses (Sage Start, Sage 50 Extra, Sage 200 Extra) à Infoniqa en 2021. Si vous cherchez "Sage Suisse", vous serez redirigé vers les produits Infoniqa.
Comment choisir le bon logiciel ?
Vos besoins déterminent la solution idéale
Pour les indépendants
Simplicité, prix accessible, QR-factures et mobilité. Recommandation : Magic Heidi ou CashCtrl
Pour les PME (5-50 employés)
Intégrations bancaires, multi-utilisateurs, gestion des salaires. Recommandation : Bexio
Pour les associations
Gratuit, gestion des membres, simplicité pour bénévoles. Recommandation : Swiss21 ou KLARA
Checklist conformité
2025
Avant de choisir (ou de garder) votre solution actuelle, vérifiez ces points essentiels pour être en conformité avec la législation suisse.
Obligatoire depuis novembre 2025
8.1%, 3.8%, 2.6%
Affiché sur les factures
Recommandé pour vos données
Questions fréquentes
Dois-je utiliser un logiciel suisse ?
Pas obligatoirement, mais c'est fortement recommandé. Les solutions internationales (Quickbooks, Zoho) ne gèrent pas toujours correctement les QR-factures, les taux de TVA suisses, ou les intégrations bancaires locales.
Puis-je changer de logiciel facilement ?
La plupart des solutions permettent d'exporter vos données en CSV ou PDF. Cependant, migrer un historique comptable complet peut être complexe. Mieux vaut choisir le bon outil dès le départ.
Un logiciel gratuit suffit-il ?
Pour un indépendant avec moins de 20 factures par mois, oui. Au-delà, les limitations (nombre de factures, fonctionnalités, support) deviennent frustrantes. Comptez CHF 10-50/mois pour une solution professionnelle.
Que faire si mon CA dépasse CHF 100'000 ?
Vous devez vous enregistrer à la TVA auprès de l'Administration fédérale des contributions. Depuis janvier 2025, l'inscription et les déclarations se font uniquement via le portail électronique. Votre logiciel doit pouvoir gérer les différents taux et générer des rapports TVA.
Créez votre première QR-facture conforme en moins de 5 minutes
Chaque mois passé avec un système inadapté vous coûte du temps et de l'argent. Magic Heidi offre l'équilibre parfait entre simplicité et conformité pour les indépendants suisses.
Dernière mise à jour : janvier 2025. Cet article sera mis à jour régulièrement pour refléter les évolutions réglementaires et tarifaires.