Tienes una tienda Shopify en Suiza y necesitas una contabilidad que encaje con tu realidad: pagos de Shopify, contabilidad simplificada, umbral del IVA a partir de CHF 100'000, recibos organizados, exportación fiscal a final de año. Estás en el sitio correcto.
Contabilidad de Shopify en 2 minutos con Magic Heidi

Así funciona en la práctica. Shopify recopila tus pedidos, procesa los pagos, los reembolsos y las comisiones, y te transfiere periódicamente un importe neto a tu cuenta bancaria. Ese pago neto es la cantidad que realmente recibes.
Para la contabilidad simplificada no tienes que reconstruir manualmente cada pedido de Shopify. Puedes registrar el pago de Shopify como un ingreso (entrada de dinero) y adjuntar el informe de pagos como justificante. Lo importante es que el informe muestre con claridad lo que hay dentro: ventas, reembolsos, comisiones e importe neto. Así tu contabilidad sigue siendo simple, pero verificable.
Importa el extracto bancario y el asiento de Shopify aparece solo
Magic Heidi detecta el abono de Shopify directamente desde la importación bancaria y crea el asiento de ingreso en segundos.
Registrar un pago en Magic Heidi es muy sencillo. Arrastras el PDF del documento de pago a Magic Heidi y nosotros leemos el importe y la fecha directamente del PDF.
Imagínate a Lucía, una diseñadora de moda ficticia de Berna con una tienda Shopify y unos CHF 80'000 de facturación anual. Trabaja como empresa individual y no está sujeta al IVA. Su contabilidad en Magic Heidi: por cada pago de Shopify arrastra el PDF, Magic Heidi crea el asiento, el justificante queda adjunto y listo. A lo largo del año son unos 40 minutos de contabilidad pura para la tienda. A final de año exporta sus ingresos, gastos y justificantes para su asesor fiscal y, de paso, se ha ahorrado entre CHF 400 y CHF 900 en herramientas de sincronización automática.
Lo esencial en pocas líneas
- La contabilidad simplificada según el art. 957 del Código suizo de las obligaciones (CO) se aplica a empresas individuales y sociedades de personas suizas con menos de CHF 500'000 de cifra de negocio en el último ejercicio.
- No necesitas contabilidad por partida doble ni tienes que registrar cada pedido de Shopify por separado.
- En la práctica, puedes registrar el pago neto de cada transferencia de Shopify como una entrada de dinero, siempre que conserves el informe de pagos de Shopify como justificante y base de conciliación.
- Las comisiones y los reembolsos de Shopify no pueden simplemente desaparecer: tienen que poder rastrearse a través del informe de pagos, sobre todo si estás sujeto al IVA o te acercas al umbral de CHF 100'000.
- La cuota mensual de la suscripción de Shopify se registra por separado como gasto del negocio.
- A partir de la obligación de IVA, una estructura GmbH/AG, el método efectivo del IVA o una facturación cercana a los CHF 500'000, conviene llevar un registro más detallado y consultarlo con un asesor fiscal.
Registra los ingresos en menos de 90 segundos
Así es el flujo mensual de Shopify en Magic Heidi, en concreto.
Qué significa la contabilidad simplificada para quienes tienen una tienda Shopify
La legislación suiza permite a las empresas individuales y a las sociedades de personas con menos de CHF 500'000 de cifra de negocio en el último ejercicio llevar la llamada contabilidad simplificada. No llevas una contabilidad por partida doble clásica como una GmbH o una AG. En su lugar, registras los ingresos, los gastos y tu situación patrimonial.
Pero "simplificada" no quiere decir "como te apetezca". Sigues necesitando registros trazables, justificantes y, a final de año, un resumen de tus activos y pasivos, de tus ingresos y gastos y de tus aportaciones y retiradas privadas. En lenguaje cotidiano: no tienes que trabajar con cuentas del libro mayor, pero tus números deben ser explicables y estar respaldados con justificantes.
En la práctica, esto significa para Shopify: si en abril Shopify te transfiere CHF 4'870 a tu cuenta bancaria, puedes registrar ese importe como una entrada de dinero. No necesitas recrear 142 pedidos uno por uno en Magic Heidi. Eso sí, el informe de pagos de Shopify forma parte del asiento, porque muestra cómo se ha generado ese importe: ventas, reembolsos, comisiones, ajustes y pago neto.
Para empresas individuales no sujetas al IVA y por debajo de los umbrales relevantes, ese suele ser el camino más pragmático: un asiento por pago, un justificante limpio adjunto y la conciliación bancaria hecha. Las comisiones de Shopify incluidas en el pago no las registras otra vez por separado como gasto, porque ya están descontadas en el pago neto. La cuota mensual de Shopify o cualquier otra app, herramienta o gasto de publicidad que se te cobre por separado sí van en tu contabilidad como gastos del negocio.
Donde la distinción se vuelve importante es en el IVA. Para el IVA no cuenta sin más lo que llega neto a tu cuenta. Lo relevante son los volúmenes de venta computables. Si te acercas al umbral de CHF 100'000 o ya estás sujeto al IVA, deberías poder rastrear con limpieza los importes brutos, los reembolsos, las comisiones y los importes de IVA de Shopify. El pago neto sigue siendo lo que entra en el banco, pero deja de ser la única base para el IVA.
Para las autoridades fiscales suizas, al final lo que cuenta es que tus flujos de dinero, justificantes y situación patrimonial sean totalmente trazables. Si en un año has recibido 12 pagos de Shopify, pueden generarse 12 asientos de ingreso. Lo decisivo es que esos asientos cuadren con tu cuenta bancaria y que conserves los informes de pagos de Shopify.
Si acabas de empezar con el tema, nuestra guía sobre software de contabilidad en Suiza te ayuda a entender lo básico para autónomos antes de perderte en detalles de plataforma. La base legal oficial de la contabilidad simplificada está en el art. 957 del Código suizo de las obligaciones.
Comisiones, reembolsos y cuotas de Shopify: qué tienes que registrar aparte
Aquí es donde la gente se lía más, así que vamos punto por punto. Las cinco categorías las tienes en el resumen justo debajo de esta sección.
Imagínate a Tomás, un dueño ficticio de una tienda de moda en Zúrich con unos CHF 180'000 de facturación anual y un plan de Shopify de CHF 39 al mes. Su año contable se ve así: 12 ingresos por pagos de Shopify, 12 gastos por la suscripción de Shopify, unos 80 justificantes de gastos de envío y unos 30 gastos adicionales del negocio entre publicidad, hosting y equipo fotográfico. En total, entre 130 y 150 asientos al año. Eso es perfectamente viable en 30 minutos al mes, incluyendo subir los justificantes.
IVA: lo que tienes que saber si vendes en Shopify desde Suiza
Por debajo de CHF 100'000 de facturación anual no tienes que registrarte para el IVA en Suiza. Si estás en ese rango, puedes saltarte esta sección. Registras el pago neto y listo.
Por encima de CHF 100'000 la cosa se complica un poco, pero sigue siendo manejable. Tienes dos métodos a elegir. Con el método del tipo de la deuda fiscal neta (Saldosteuersatz) conservas tu lógica simplificada: el pago neto como ingreso. A ese importe bruto le aplicas el tipo de deuda fiscal neta fijado para tu sector, que para una venta online típica está entre el 2,1% y el 5,1%. Este método es ideal para la contabilidad simplificada. Tienes más detalles en nuestra guía sobre el IVA para freelancers.
Con el método efectivo registras los ingresos brutos por pedido, el IVA por separado y deduces el IVA soportado de tus gastos. Es bastante más laborioso y, en el contexto de Shopify, suele ser cosa de tiendas por encima de CHF 500'000 o de tiendas con una proporción alta de clientes empresariales que se deducen el IVA.
Consejo práctico: si acabas de superar el umbral de CHF 100'000, regístrate para el IVA y elige el Saldosteuersatz. Así tu contabilidad sigue siendo sencilla, cumples con la obligación suiza y la carga administrativa no se duplica. Si tienes dudas, llama a la oficina cantonal de impuestos o a la ESTV (la Administración Federal de Contribuciones). Comparadas con las de otros países, las autoridades suizas son sorprendentemente cooperativas y dispuestas a ayudar.
Una nota breve sobre las comisiones de Shopify y el impuesto sobre las adquisiciones (Bezugssteuer): Shopify factura desde Irlanda, es decir, desde la UE. Si estás sujeto al IVA con el método efectivo, entra en juego la cuestión del impuesto sobre las adquisiciones, porque recibes servicios desde el extranjero. Con el Saldosteuersatz suele no ser un tema. En caso de duda, acláralo con tu asesor fiscal, porque la respuesta depende de tu situación concreta.
Registra un pago de Shopify en 4 pasos
El proceso concreto en Magic Heidi, una vez por pago.
Abre Magic Heidi
En el móvil o en el ordenador, funciona igual en los dos.
Crea el ingreso
Indica el importe del pago neto, la fecha y una descripción breve como 'Pago Shopify abril 2026'.
Sube el justificante
Adjunta el PDF de pago de Shopify o el justificante de la transacción bancaria, o arrastra el PDF directamente y Magic Heidi crea el asiento automáticamente.
Guarda
Magic Heidi lo categoriza automáticamente y lo incorpora a tus informes de facturación.
Cuándo el método simple se queda corto
Estamos aquí para ahorrarte tiempo y dinero, pero también para ser honestos: el método de 2 minutos no encaja con todas las tiendas. Las cuatro situaciones en las que conviene una contabilidad más detallada las tienes en el resumen más abajo. En cualquiera de esos casos, te recomendaríamos hablar con un asesor fiscal suizo y evaluar una solución más especializada. Magic Heidi está pensado a propósito para autónomos en solitario por debajo de CHF 500'000, no para operaciones de e-commerce en plena escalada. El número de pedidos al mes, por cierto, no es un límite: tanto si gestionas 10 como si gestionas 1'000 pedidos, en Magic Heidi sigue siendo un ingreso por pago, porque Shopify se ocupa de todos los detalles de pedidos, reembolsos y chargebacks en su propio panel.
Si acabas de empezar y te estás preguntando si la empresa individual en Suiza tiene sentido para ti, empieza por ahí. La elección de la forma jurídica influye directamente en qué tipo de contabilidad necesitas.
Para terminar, imagínate a Marina, una dueña ficticia de tienda en Lausana. Empezó en 2023 con CHF 60'000 de facturación y el método de 2 minutos, creció en dos años hasta los CHF 320'000, ahora está sujeta al IVA con Saldosteuersatz y sigue haciendo su contabilidad en Magic Heidi en unos 30 minutos al mes. Cuando algún día llegue a los CHF 500'000, cambiará. Hasta entonces, se ha ahorrado unos CHF 800 al año en costes de sincronización automática, más horas de asesor fiscal, porque sus libros están limpios y son simples.
Resumen: cómo debería verse tu contabilidad de Shopify en Suiza
Tres cosas que te puedes quedar. Por debajo de CHF 500'000 de facturación anual, basta con registrar una vez por pago el importe neto de Shopify como ingreso, más la cuota de suscripción de Shopify como gasto aparte. Te ahorras entre CHF 400 y CHF 900 al año en software de sincronización automática, porque como autónomo en solitario no lo necesitas, más horas de configuración y de corregir errores. Cuando llegues a los CHF 500'000, fundes una GmbH o tengas que trabajar con el método efectivo del IVA, pasas a una contabilidad más detallada. Hasta entonces: keep it simple.
Magic Heidi está hecho por dos freelancers suizos que tuvieron exactamente estos problemas. Usamos nuestro propio software para nuestra contabilidad, y está diseñado precisamente para estos casos: para empresas individuales que facturan con Shopify, Stripe, App Store o Play Store y quieren mantener sus libros limpios, rápidos y conformes a la ley. Si emites facturas fuera de Shopify, por ejemplo a clientes empresariales de forma directa, nuestro software de facturación te ayuda a crear facturas con QR en menos de un minuto.
Comisiones, reembolsos y cuotas de Shopify
Qué partidas ya están incluidas en el pago neto y cuáles tienes que registrar por separado.
Comisiones de transacción de Shopify
Ya están descontadas del pago neto. No tienes que registrar nada más: la oficina fiscal solo ve el dinero que entra en tu cuenta.
Reembolsos y chargebacks
Ya están considerados en el pago neto. CHF 6'200 brutos menos CHF 420 de reembolso menos CHF 165 de comisiones = CHF 5'615 como ingreso. Listo.
Cuota de suscripción de Shopify
Basic, Shopify o Advanced se cobra mensualmente en tu cuenta bancaria. Regístralo como gasto del negocio aparte, con la factura de Shopify como justificante.
Suscripciones a apps
Las apps de la Shopify App Store funcionan igual que la cuota: gasto del negocio aparte, por mes o por factura.
Gastos de envío
Correos, DHL u otros proveedores externos: gasto aparte con los justificantes correspondientes.
Cuándo el método simple se queda corto
Cuatro situaciones en las que una contabilidad más detallada tiene sentido de verdad.
Umbral de CHF 500'000
A partir de esta cifra la contabilidad por partida doble es obligatoria. Necesitarás software como bexio, sevDesk o una solución con asesor fiscal.
GmbH o AG
Incluso por debajo de CHF 500'000, en estas formas jurídicas la contabilidad por partida doble es obligatoria por ley.
Almacén e inventario
El control de stock necesita un software que soporte valoración de existencias y gestión de materiales.
Método efectivo del IVA
Registrar ingresos brutos e IVA soportado por separado solo merece la pena con una herramienta que lo automatice.
Preguntas frecuentes sobre la contabilidad de Shopify en Suiza
¿Necesito una conexión automática entre Shopify y mi contabilidad?
No. Bajo la contabilidad simplificada en Suiza, es decir, con una empresa individual y una facturación inferior a CHF 500'000 al año, no necesitas ninguna conexión técnica. Registras una vez por pago el importe neto. Las herramientas de auto-sync son útiles a partir de facturaciones más altas o cuando llevas contabilidad por partida doble, no para tiendas en solitario.
¿Cómo registro los reembolsos a clientes en mi contabilidad de Shopify?
Los reembolsos ya están descontados de tu pago neto, no tienes que registrarlos por separado. Si en abril devolviste CHF 500, esa cifra ya está considerada en el importe de tu pago. Solo registras lo que realmente llegó a tu cuenta.
¿Cuál es la forma más rápida de subir el documento de pago de Shopify?
Magic Heidi acepta justificantes en PDF (no CSV). La vía más rápida: descarga el PDF de pago desde tu panel de Shopify y arrástralo a Magic Heidi. Nosotros leemos el importe y la fecha automáticamente y creamos el asiento de ingreso, con el PDF como justificante. En lugar del PDF de Shopify también vale el justificante de la transacción de tu banco suizo que documenta el abono de Shopify. Los dos sirven como prueba por igual.
¿Cómo registro la cuota de suscripción de Shopify (Basic, Shopify, Advanced)?
Como gasto del negocio aparte en Magic Heidi, con la factura de Shopify como justificante. Shopify carga la cuota directamente cada mes y no está incluida en los pagos por ventas.
¿Y qué pasa con el IVA en mis ventas de Shopify?
Por debajo de CHF 100'000 de facturación anual no estás sujeto al IVA, no tienes que declarar nada. Por encima de CHF 100'000 recomendamos el método del tipo de la deuda fiscal neta (Saldosteuersatz), porque es compatible con la contabilidad simplificada. Tienes más detalles en nuestra guía del IVA para freelancers.
¿Es suficiente para la declaración de impuestos de final de año?
Sí. Con una lista de tus ingresos mensuales de Shopify, tus gastos y todos los justificantes puedes hacer tu declaración de impuestos como empresa individual suiza o enviar a tu asesor fiscal una exportación limpia. Ese es exactamente el objetivo de la contabilidad simplificada.
¿Y si Shopify me paga en otra moneda?
Shopify suele pagar a las cuentas suizas en CHF, aunque tus clientes hayan pagado en EUR o USD. La conversión del tipo de cambio se hace en el lado de Shopify y tú registras directamente el importe en CHF que llega a tu cuenta bancaria.
¿Debería hablar con mi asesor fiscal antes de cambiarme a Magic Heidi?
Si ya trabajas con alguien, sí, una llamada corta nunca está de más. A la mayoría de asesores fiscales les encanta cuando sus clientes les entregan justificantes digitales bien organizados e ingresos limpios, en lugar de cajas de zapatos llenas de tiques. Probablemente te darán luz verde y, de paso, te ahorrarás horas de asesor.
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